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目次

第1章 生態遺伝学のための集団遺伝学入門

  1.1 2つの遺伝モデル:集団遺伝と量的遺伝

  1.2 突然変異

  1.3 移住(遺伝子流動)

  1.4 選択

  1.5 遺伝的浮動

  BOX1:分子進化の中立説とほぼ中立説

第2章 量的遺伝学入門

  2.1 狭義の遺伝率と育種家方程式

  2.2 選択勾配

  2.3 遺伝的相関による進化のバイアス

  BOX2:育種家方程式と選択勾配の関係

第3章 適応進化の遺伝基盤:表現型から迫る

  3.1 適応・適応度とは?

  3.2 適応形質を見つける

  3.3 適応形質の遺伝基盤を探る手法:QTLマッピング

  3.4 適応形質の遺伝基盤を探る手法:GWAS

  3.5 原因遺伝子座を絞り込めると選択係数(s)を計算できる

  3.6 フィッシャーの幾何学モデル

  BOX3.1:選択勾配

  BOX3.2:野生生物における選択勾配β

  BOX3.3:QTLマッピングやGWASに用いる個体数やマーカー数は?

第4章 適応進化の遺伝基盤:ゲノムから迫る

  4.1 ゲノム配列から選択の痕跡を探る

  4.2 選択的一掃

  4.3 連鎖不平衡

  4.4 遺伝子系図とアリル頻度スペクトラム

  4.5 遺伝的多様性の尺度πとS

  4.6 コアレセント理論

  4.7 Tajima's D

  4.8 どのくらい前の選択的一掃まで解析可能なのか

  BOX4:コアレセント理論を用いた集団履歴解析

第5章 適応進化の分子機構

  5.1 遺伝基盤とは?

  5.2 原因変異の特定と解析

  5.3 どういった突然変異が重要か?

  5.4 収斂進化の遺伝基盤と予測可能性

  カラム:「決定論と偶発性」グールドの生命のテープのリプレイ思考実験

第6章 種分化の定義および内因性雑種異常の遺伝基盤

  6.1 種分化の定義

  6.2 種分化の遺伝基盤に迫るアプローチ

  6.3 ドブジャンスキー・マラー不適合

  6.4 ドブジャンスキー・マラー不適合によって生じるF1の異常

  6.5 戻し交配で生じる異常

  6.6 F2雑種で生じる異常

  6.7 ヘテロ接合体における適応度低下によるF1雑種の異常

  BOX6.1:どこまでをドブジャンスキー・マラー不適合と呼ぶのか?

  BOX6.2:種分化の2つの法則

第7章 生態的種分化と種分化ゲノム

  7.1 生態的種分化

  7.2 隔離遺伝子座

  7.3 遺伝的分化の指標としてのFST

  7.4 分化のゲノム島と種分化連続体

  7.5 組換え抑制と種分化

  BOX7.1:外因性雑種不適合

  BOX7.2:単一アリル種分化

  BOX7.3:FSTを分散で記述する

  カラム:聖ロザリアへのオマージュ

第8章 性的二型の進化遺伝機構

  8.1 性の進化

  8.2 異型配偶子の進化

  8.3 雌雄間での異類交配の進化

  8.4 性的葛藤

  8.5 性的二型の進化

  カラム:赤の女王仮説

第9章 性染色体進化の遺伝機構

  9.1 多様な性決定メカニズム

  9.2 性染色体進化の古典的モデル

  9.3 減数分裂ドライブ

  9.4 性染色体のターンオーバー

  BOX9:種分化の2つの法則と性染色体

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