資料詳細

[ 和図書 ] ゲノム配列情報解析 ( バイオインフォマティクスシリーズ 5 )

三澤計治／著 -- コロナ社 -- 2024.8 --

所蔵

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ISBN	4-339-02735-8
ISBN13桁	978-4-339-02735-8
タイトル	ゲノム配列情報解析
タイトルカナ	ゲノムハイレツジョウホウカイセキ
著者名	三澤計治／著, 浜田道昭／監修
著者名典拠番号	110008357030000 , 110006912810000
出版地	東京
出版者	コロナ社
出版者カナ	コロナシャ
出版年	2024.8
ページ数	12, 289p
大きさ	21cm
シリーズ名	バイオインフォマティクスシリーズ
シリーズ名のルビ等	バイオインフォマティクスシリーズ
シリーズ番号	5
シリーズ番号読み	5
価格	¥4700
内容紹介	ゲノム配列情報解析に必要な、生物学の知識とプログラミングの技術を同時に記載し、プログラミング言語「Python」の解説も加えたテキスト。ゲノム解析で使われるデータファイルのフォーマットも掲載する。
書誌・年譜・年表	文献:p271～281
一般件名	バイオインフォマティクス
一般件名カナ	バイオインフォマティクス
一般件名典拠番号	511570600000000
分類：都立NDC10版	467.3
資料情報1	『ゲノム配列情報解析』（バイオインフォマティクスシリーズ 5）　三澤計治／著, 浜田道昭／監修　コロナ社　2024.8（所蔵館：中央　請求記号：/467.3/5161/2024　資料コード：7118223280）
URL	https://catalog.library.metro.tokyo.lg.jp/winj/opac/switch-detail.do?lang=ja&bibid=1154641498

1.文字とコンピューター: 1.1 コンピューターの仕組み; 1.2 コンピューターにおける文字と符号化; 1.3 圧縮とハッシュ; 1.4 Pythonの利用; 1.5 計算量の評価; 章末問題
2.ゲノム配列決定とDNA: 2.1 DNAの性質; 2.2 複製; 2.3 配列決定; 2.4 k‐mer法; 2.5 デノボアセンブリ; 2.6 マッピング; 2.7 染色体; 2.8 転写とRNA; 章末問題
3.ペアワイズアラインメント: 3.1 最適化問題としてのペアワイズアラインメント推定; 3.2 DNA間のスコア; 3.3 アミノ酸間のスコア; 3.4 最適化問題とその難しさ; 3.5 動的計画法; 3.6 加藤ら(2002)のアルゴリズムとMAFFT; 3.7 Biopythonによるアラインメントアプリケーションの呼び出し; 章末問題
4.分子系統樹推定と多重配列アラインメント: 4.1 進化距離と進化速度; 4.2 進化距離推定をもとにした分子系統樹再構築法; 4.3 多重配列アラインメント; 章末問題
5.機能解析と相同性検索: 5.1 統計的仮説検定; 5.2 ゲノムワイド関連解析による疾患関連遺伝子の探索; 5.3 相同性検索; 5.4 アノテーション; 5.5 ゲノム配列の変化とタンパク質の機能の関係についての今後の展開; 章末問題
付録: A.1 Pythonの基本文法; A.2 ファイルフォーマット; A.3 ベクトルと行列; A.4 解析関数; A.5 統計にかかわる関数